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GENO 3.3.2 – Analyse de données RNA-seq avec le logiciel R

Utiliser le logiciel R pour traiter et analyser des données génomiques.
Prochaine session : à venir
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Présentation

 

Cette formation enseigne l’utilisation de R pour traiter et analyser des données génomiques RNA-seq. En deux sessions de 3 heures à distance, elle combine théorie (60%) et pratique (40%) pour fournir une compréhension complète de l’analyse RNA-seq, de la préparation des données à l’interprétation des résultats.

Programme

1. Introduction générale

  • Introduction à l’analyse de données NGS

  • Présentation générale des outils d’analyse

2.  RNA-SEQ

  • Rappels sur l’ARN et l’expression

  • Design expérimental, questions biologiques et contraintes en terme d’analyse

  • Protocole expérimental RNA-seq

  • Notions de statistiques essentielles pour les analyses de données de séquences RNA-seq

3. Analyse de données RNA-SEQ

  • Alignement des lectures (reads) sur un génome de référence (algorithmes et outils)

  • Quantification de l’expression, visualisation et détection des anomalies

  • Expression différentielle et interprétation des résultats

A. En pratique – RNA-seq : des reads à la quantification de l’expression
B. En pratique – RNA-seq : expression différentielle

  • Introduction à l’analyse de données NGS

  • Présentation générale des outils d’analyse

  • Rappels sur l’ARN et l’expression

  • Design expérimental, questions biologiques et contraintes en terme d’analyse

  • Protocole expérimental RNA-seq

  • Notions de statistiques essentielles pour les analyses de données de séquences RNA-seq

  • Alignement des lectures (reads) sur un génome de référence (algorithmes et outils)

  • Quantification de l’expression, visualisation et détection des anomalies

  • Expression différentielle et interprétation des résultats

  • Droit de l’IA et de la médecine digitale 
  • Éthique, Déontologie et Responsabilité en médecine digitale 
  • Questions épistémologiques soulevées par l’IA en Médecine
  • L’IA et son intégration dans la méthodologie médicale 
  • Droit de l’IA et de la médecine digitale 
  • Éthique, Déontologie et Responsabilité en médecine digitale 
  • Questions épistémologiques soulevées par l’IA en Médecine
  • L’IA et son intégration dans la méthodologie médicale 

Méthodologie

Théorie
Pratique

Objectif

Connaître les principales méthodes et outils d’analyse des données RNA-seq et pouvoir les mettre en œuvre  avec le logiciel R

Equipe pédagogique

Intervenant

Matthieu Defrance
Senior Researcher at IB2
Université libre de Bruxelles

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Gros plan sur une main en train de taper sur le clavier d’un ordinateur portable, symbolisant le travail, l’apprentissage en ligne ou l’utilisation des technologies numériques dans un cadre professionnel ou éducatif.

Infos pratiques

Horaire

2 session de 3 heures

Prochaine session : 

  • à venir

Lieu

En distanciel synchrone* via Teams

Admission

Pour qui

Biologistes, responsables de projets, chercheurs du secteur biotechnologique qui sont amenés à réaliser des expériences de RNA-seq

Prérequis

Tarifs

Tarif plein :

  • 380€

Tarif réduit pour les institutions publiques, académiques et ASBL :

  • 270 €

Tarif réduit pour les doctorants & institutions hospitalières ULB :

  •  190€

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Contact

Valérie LAMBERT

Coordinatrice de formation

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F.A.Q

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Si les inscriptions ne sont pas ouvertes, vous avez la possibilité de manifester votre intérêt pour cette formation en cliquant sur le bouton « cette formation m’intéresse !« 
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Tous nos programmes peuvent être adaptés pour répondre aux besoins spécifiques de votre entreprise, que ce soit en termes de modalités d’apprentissage, de contenu ou de durée. Nous collaborons avec vous pour comprendre votre projet et vous proposer des solutions sur mesure.

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